2020年11月30日 星期一

安裝 bcftools

 #!/bin/bash
# install  bcftools
# https://samtools.github.io/bcftools/

pwd=$(pwd);
target=/opt/
cd ${target};
apt install -y git automake libgsl-dev libcurl4-openssl-dev
git clone --recurse-submodules git://github.com/samtools/htslib.git

git clone git://github.com/samtools/bcftools.git
cd bcftools
# The following is optional:
#autoheader && autoconf && ./configure --enable-libgsl --enable-perl-filters
make
ln -s ${target}/bcftools/bcftools /usr/local/bin/bcftools
cd ${pwd};

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